АЛГОРИТМЫ ГЕНЕРАЦИИ И ОБРАБОТКИ SEM-ИЗОБРАЖЕНИЙ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ СВОЙСТВ БИОНЕОРГАНИЧЕСКИХ МАТРИЦ И МЕТОДЫ ИХ ВЕРИФИКАЦИИ
Аннотация
Одним из распространенных методов анализа характеристик материалов, получаемых в ре- зультате химического синтеза, является сканирующая электронная микроскопия (SEM), примене- ние которой позволяет получить изображения с высоким разрешением и увеличением. В статье исследуются алгоритмы анализа изображений материалов, обладающих определенными свойст- вами (например, пористостью) – бионеорганических матриц. Пористые структуры представля- ют собой обширный класс материалов с широкой областью применения, включая сельское хозяй- ство, медицину, катализ и многое другое. Одна из важных сфер использования подобных структур – тканевая инженерия, в которой подобные каркасы необходимы для обеспечения восстанови- тельных процессов тканей организма. И для каждого организма матрицы должны быть персона- лизированными, что требует выполнения трудоемкого процесса по подбору характеристик кар- каса, применимого в конкретном случае. Эта задача в настоящее время частично решается при- менением технологий искусственного интеллекта для повышения точности или поддержки при- нятия решения во время изготовления или анализа матрицы. Однако, часть работы в этом процессе все еще выполняется вручную и представляет из себя трудозатратную рутину для специалиста. В частности, процесс анализа SEM-изображений с целью вычисления характеристик полученного материала все еще представляет множество длительных этапов с использованием различных ин- струментов. При этом такие характеристики как пористость, извилистость, диффузность явля- ются очень важным фактором для эксперта в процессе принятия решения о применимости изго- товленной бионеорганической матрицы в каждом конкретном случае. Соответственно целью дан- ного исследования является разработка комплекса алгоритмов для полностью автоматической об- работки SEM-изображений. Также, исходя из поставленной цели, в рамках исследования можно выделить ряд задач: разработка алгоритмов для детекции объектов на изображении, разработка модели нейронной сети для уточнения результатов детекции, реализация алгоритмов вычисления характеристик пористого материала, а также проектирование и выполнение ряда верификацион- ных испытаний для подтверждения качества выполненных вычислений. В результате проведенного исследования мы сделали некоторые выводы. В частности, подход, использующий генерацию синте- тических данных, может существенно ускорить и упросить процесс обучения нейронной сети, а также повысить качество выходной модели. Далее мы заключили, что полученные алгоритмы мо- гут полностью автоматизировать процесс анализа SEM-изображений с пористой структурой, а качество вычислений подтвердили с помощью ряда верификационных тестов. Полученные алго- ритмы могут быть распространены на другие аналогичные задачи, связанные с проблемами ана- лиза изображений и выявления необходимых признаков и характеристик.
Список литературы
1. Sultana N. Mechanical and biological properties of scaffold materials, Functional 3D Tissue Engineering
Scaffolds, 2018, pp. 1-21.
2. Mosalaganti S., Kosinska A., Siggel M., Taniguchi R., Zimmerli C., Hagen W., Beck M. AI-based
structure prediction empowers integrative structural analysis of human nuclear pores, Science, 2022,
Vol. 376, No. 6598.
3. Laldinthari S., Akriti T., Jugal B., Punuri J.B. Various manufacturing methods and ideal properties of scaffolds
for tissue engineering applications, Smart Materials in Manufacturing, 2023, Vol. 1, pp. 100011.
4. Chen M, Jiang R., Deng N., Zhao X., Li X. Natural polymer-based scaffolds for soft tissue repair,
Front. Bioeng. Biotechnol, 2022.
5. Nahanmoghadam A., Asemani M., Goodarzi V., Barough S. In vivo investigation of
PCL/PHBV/Hydroxyapatite Nanocomposite Scaffold in Regeneration of Critical-sized Bone Defects,
Fibers Polym, 2021, Vol. 22, No. 9, pp. 2507-2516.
6. Rezaee S., Shahrokhian S. Facile synthesis of petal-like NiCo/NiO-CoO/nanoporous carbon composite
based on mixed-metallic MOFs and their application for electrocatalytic oxidation of methanol, Applied
Catalysis B: Environmental, 2019, Vol. 244, pp. 802-813.
7. Lanaro M., Mclaughlin M., Simpson M., Buenzli P., Wong C., Allenby M., Woodruff M. A quantitative
analysis of cell bridging kinetics on a scaffold using computer vision algorithms, Acta Biomaterialia,
2021, Vol. 136, pp. 429-440.
8. Wan H., Huang X., Junpeng W., Zhang Z. Importance of appropriate segmentation in pore structure
analysis of coral reef limestone from CT images, Marine Georesources & Geotechnology, 2023,
Vol. 42, No. 4, pp. 327-347.
9. Shi X., Misch D., Vranjes-Wessely S. A comprehensive assessment of image processing variability in
pore structural investigations: Conventional thresholding vs. machine learning approaches, Gas Science
and Engineering, 2023, Vol. 115, pp. 205022.
10. Kolomenskaya E., Butova V., Poltavskiy A., Soldatov A., Butakova M. Application of Artificial Intelligence
at All Stages of Bone Tissue Engineering, Biomedicines, 2023, Vol. 12, No. 1, pp. 76.
11. Wright A. S., Youmans N. P., Araya E. F. V. Recursive Detection and Analysis of Nanoparticles in
Scanning Electron Microscopy Images, 2023.
12. De Ridder V., Dey B., Dehaerne E., Halder S., Gendt S., Waeyenberge B. SEMI-CenterNet: A Machine
Learning Facilitated Approach for Semiconductor Defect Inspection, 2023.
13. Kim Y.-H., Vijayavenkataraman S., Cidonio G. Biomaterials and scaffolds for tissue engineering and
regenerative medicine, BMC Methods, 2024, Vol. 1, No. 1.
14. Aversa R., Modarres M., Cozzini S., Ciancio R., Chiusole A. The first annotated set of scanning electron
microscopy images for nanoscience, Sci Data, 2018, Vol. 5, No. 1.
15. Polyanichenko D.S., Chernov A.V., Kartashov O.O., Alexandrov A.A., Butova V.V., Butakova M.A.
Intelligent Detection of the Nanomaterials Spatial Structure with Synthetic Electron Microscopy Images,
2022 XXV International Conference on Soft Computing and Measurements (SCM), 2022.
16. Kartashov O.O., Chapek S.V., Polyanichenko D.S., Belyavsky G.I., Alexandrov A.A., Butakova M.A.,
Soldatov A.V. Online Microfluidic Droplets Characterization Using Microscope Data Intelligent Analysis,
BDCC, 2023, Vol. 7, No. 1, pp. 7.
17. Alexandrov A.A., Kartashov O.O., Polyanichenko S.S., Nebaba A.N., Polyanichenko D.S., Butakova
M.A. Intelligent Analysis of Optical Microscopy Images for Microfluidic Synthesis Results, 2023
XXVI International Conference on Soft Computing and Measurements (SCM), 2023, pp. 297-300.
18. Poltavskiy A., Kolomenskaya E., Beliavsky G., Butova V., Butakova M. Synthesis and Analysis of Porous
Frame Structures Images Using Machine Learning Methods, Lecture Notes in Networks and Systems,
2024, pp. 389-401.
19. Yuan L., Liu Z., Tian C., Yan Z., Yu J., Hou X., Zhu Q. Structure and properties of Al2O3-bonded porous
fibrous YSZ ceramics fabricated by aqueous gel-casting, Ceramics International, 2021, Vol. 47,
No. 18, pp. 250-265.
20. Rosentreter H., Walther M., Lerch A. Partial Desalination of Saline Groundwater: Comparison of
Nanofiltration, Reverse Osmosis and Membrane Capacitive Deionisation, Membranes, 2021, Vol. 11,
No. 2, pp. 126.